Bio- informatica

De student leert in ‘Bio-informatica’ databanken gebruiken. De student heeft bij aanvang van ‘Gepersonaliseerde geneeskunde in diagnose en therapie’ volgende reeds verworven kennis en vaardigheden nodig uit ‘Bio- informatica’:

• De student kan de begrippen uit de moleculaire biologie, genetica en epigenetica - en meer concreet: genregulatie, epigenetische mechanismen en NGS technologie - toelichten;

• De student kan de begrippen uit de kankergenetica en meer concreet: oncogenen, tumorsuppressorgenen, stabiliteitsgenen in het kankerproces - toelichten;

• De student herkent volgende begrippen uit de ‘Bio-informatica’: primer design, NGS en sequentie data- analyse, en kan varianten opsporen;

• De student herkent de huidige samenwerkingsverbanden tussen de databanken GenBank, Entrez, BLAST, OMIM, CDD, Gene en Structure;

• De student kan gebruik maken van de geïntegreerde databank-bevragingssystemen aan de hand van zoekopdrachten;

• De student herkent een patroon, een profiel en een domein in een eiwit;

• De student kan de concepten die belangrijk zijn bij de design van sequentie specifieke PCR primers onderscheiden en toepassen bij specifieke opdrachten;

• De student kan de aangebrachte bio databases, zoekmachines en tools gecombineerd toepassen aan de hand van typische onderzoeksvraagstellingen voor eiwit- en nucleïnezuur analyses;

• De student begrijpt de hiërarchie in biologische data en kan biologische pathways en netwerken herkennen.

Celpathologie

De student heeft kennis en inzicht in:

1. Celtypen en hun normale groei en adaptatiereacties ten opzichte van stress
   2. Normale celcyclus, celdifferentiatie en verstoorde intercellulaire communicatie
   3. Indeling,nomenclatuur van neoplasie, verstoorde celcyclus
   4. Processen van aging
   5. De gradering en stadiëring van tumoren
   6. Processen van apoptose en necrose
   7. Processen van invasie en metastasering
   8. Angiogenese en hypoxie

Moleculaire Genetica en Epigenetica

• De student kan de structuur van DNA, RNA en eiwitten beschrijven;

• De student kan in eigen woorden uitleggen hoe replicatie, transcriptie en translatie werken;

• De student kan de verschillende vormen van RNA in de cel en hun functie beschrijven en toelichten;

• De student weet en kan de regulatie van genexpressie toelichten;

• De student kan de verschillende types mutaties toelichten en mogelijke herstelmechanismen beschrijven;

• De student kan het werkingsmechanisme van volgende technieken toelichten: DNA-klonering, gel-elektroforese, Southern blot, Northern blot, PCR, micro-array, SANGER.

De student kan de volgende termen verklaren:

• DNA, RNA, cDNA, eiwit, genoom, chromosoom, centromeer, chromatine, nucleosoom, histon, gen, helix, sequentie, basepaar, nucleotide, ribonucleotide, codon, aminozuur, intron, exon, ORF, coderende sequentie, leesraam, replicatie, transcriptie, translatie, DNA-polymerase, RNA-polymerase, enhancer, telomerase, top-isomerase, ‘origin of replication’, transcriptiefactoren, template-streng, elongatie, promotor, 5’UTR, 3’UTR, splicing (anti)codon, stopcodon, snRNA, mRNA, tRNA, rRNA, inducer, repressor, TATA-box, RFLP, SNP, STR, VNTR, additie, deletie, aneuploïdie, duplicatie, translocatie, recombinatie, DNA-polymorfismen, DNA-klonering, gelelektroforese, Southern blot, Northern blot, PCR, micro-array, Sanger sequencing, expressievectoren, hybridisatie, probe, restrictie enzyme.

Moleculaire diagnostiek en patiënt selectie:

- Je kan de moleculaire technologieën gebruikt bij de diagnostiek benoemen, interpreteren en samenvatten en je kan deze toepassen bij (gepersonaliseerde) therapie ontwikkeling.

- Je begrijpt hoe een kandidaat target kan gezocht worden dat betrokken is bij een ziektebeeld.

- Je kent het onderscheid tussen susceptibiliteitsgenen en ziekte-veroorzakende genen.

(Targeted) Therapie en resistentie:

- Je begrijpt de mechanismen van de verschillende (target gerichte) kanker (cel)therapieën.

- Je kan de invloed van individuele moleculaire variaties op de efficiënte werking van geneesmiddelen weergeven.

- Je kan illustreren hoe de analyse van moleculaire variaties en genetische achtergrond bij populaties kan bijdragen tot een patiëntgerichte en meer efficiënte behandeling.

- Je begrijpt de mechanismen hoe tumoren resistentie vertonen tegen klassieke en targeted therapieën.

- Je kan weergeven hoe een therapie kan opgevolgd worden door middel van moleculaire merkers.

Het traject van ontdekking, valorisatie, ontwikkeling en toegang tot de markt voornieuwe geneesmiddelen:

- Je kan de methoden van geneesmiddelenontwikkeling verduidelijken

- Je kan de ontwikkeling van farmaca gericht op targets afkomstig uit target selectieprocedures toelichten.

- Je hebt inzicht in de beginselen van valorisatie.

- Je kan de beginselen in de organisatie van de gezondheidszorg, goedkeuring enterugbetaling uitleggen